მაკოტო კონო საშუალო სკოლის ბოლო კურსზეა, მაგრამ უჭირს იმის გადაწყვეტა, რა გააკეთოს მის მომავალთან. მასწავლებლების ზეწოლისა და საუკეთესო მეგობრებთან დროის გატარებას შორის, მაკოტოს ცხოვრება მოულოდნელად იცვლება, როდესაც ის შემთხვევით აღმოაჩენს, რომ შეუძლია სიტყვასიტყვით გადალახოს დრო. Toki wo Kakeru Shoujo მიჰყვება მაკოტოს, როდესაც ის თამაშობს თავის ახლად აღმოჩენილ ძალასთან. თუმცა, ის მალე გაიგებს რთულ გზას, რომ ყველა არჩევანს აქვს შედეგი და დრო ბევრად უფრო რთულია, ვიდრე შეიძლება ჩანდეს.

იაპონია, 1988 წ. ფსიქიკური ძალის მქონე ახალგაზრდა ბიჭის მიერ გამოწვეული აფეთქება ატრიალებს ქალაქ ტოკიოს და აანთებს დაუკრავენ, რომელსაც მივყავართ მესამე მსოფლიო ომამდე. შემდგომი განადგურების თავიდან აცილების მიზნით, ის შეიპყრეს და დააპატიმრეს, რომ აღარასოდეს გაიგოს. ახლა, 2019 წელს, მის ადგილზე დგას ქალაქის აღდგენილი ვერსია, რომელიც ცნობილია როგორც ნეო-ტოკიო - ბანდების ძალადობითა და ტერორიზმით სავსე ტერიტორია ამჟამინდელი ხელისუფლების წინააღმდეგ. აქ Shoutarou Kaneda ხელმძღვანელობს "კაფსულებს", შეუფერებელთა ჯგუფს, რომელიც ცნობილია დიდი, მორგებული მოტოციკლების ტარებით და მუდმივი კონფლიქტით მათ კონკურენტებთან "კლოუნებთან". ერთ-ერთი ასეთი ბრძოლის დროს შოტარუს საუკეთესო მეგობარი ტეცუო შიმა ავარიაში მოჰყვება ესპერს, რომელიც ტოკიოს ქუჩებში სამთავრობო დაწესებულებიდან გაქცევის შემდეგ აღმოჩნდება. ამ შეხვედრის საშუალებით, ტეცუო იწყებს საკუთარი იდუმალი შესაძლებლობების განვითარებას, რადგან მთავრობა ცდილობს ამ უკანასკნელი ექსტრასენსის კარანტინაციას, სასოწარკვეთილი მცდელობით, ხელი შეუშალოს მას დესტრუქციული ძალის გათავისუფლებაში, რამაც შეიძლება კიდევ ერთხელ დააჩოქოს ქალაქი.